| Ligne ou section de ligne | Nom | Numéro | Commune(s) | Type | Observations |
|---|---|---|---|---|---|
| Paris-Est (70) - Mulhouse-Ville (70) | Grattery | 70421.1 | Port-sur-Saône Grattery | Vrai tunnel | Détruit |
| Genevreuille | 70262.1 | Genevreuille | Vrai tunnel | ||
| Challière | 70120.1 | Champagney Plancher-Bas | Vrai tunnel | ||
| Ligne Rhin-Rhône (LGV) (25) | Chavanne LGV | 70147.1 | Chavanne Aibre | Vrai tunnel | |
| Houillères de Ronchamp (70) | Arthur de Buyer | 70318.1 | Magny-Danigon | Vrai tunnel | E 100 Minier |
| Lure (70) - Le Thillot (88) | Col des croix | 70283.1 | Haut-du-Them-Château-Lambert Le Thillot | Vrai tunnel | E 100 |
| Blainville-Damelevières (54) - Lure (70) | Fontaine-lès-Luxeuil | 70240.1 | Fontaine-lès-Luxeuil Luxeuil-les-Bains | Vrai tunnel | |
| Gray (70) - Saint-Jean-de-Losne (21) | Mantoche | 70331.1 | Mantoche | Vrai tunnel | |
| Tunnel en service |
| Tunnel non exploité ou abandonné |
| Tunnel remarquable |
Ligne ou section de ligne :
Le nombre entre parenthèses indique le numéro du département.
Le sens des sections n'est pas nécessairemement le même que celui des lignes.
Communes :
La première ligne indique la commune sur laquelle est située l'entrée du tunnel.
La seconde ligne indique la commune sur laquelle est située la sortie du tunnel.
Si une seule commune est indiquée, les entrée et sortie du tunnel sont situées sur cette même commune.
Observations :
Pour les lignes à voie étroite, l'écartement est précisé en centimètres (par ex : E 100 pour une voie métrique).