| Ligne ou section de ligne | Nom | Numéro | Commune(s) | Type | Observations |
|---|---|---|---|---|---|
| Paris-Est (70) - Mulhouse-Ville (70) | Grattery | 70421.1 | Port-sur-Saône Grattery | Tunnel percé | Détruit |
| Genevreuille | 70262.1 | Genevreuille | Tunnel percé | ||
| Challière | 70120.1 | Champagney Plancher-Bas | Tunnel percé | ||
| Houillères de Ronchamp (70) | Arthur de Buyer | 70318.1 | Magny-Danigon | Tunnel percé | E 100 Minier |
| Lure (70) - Le Thillot (88) | Col des croix | 70283.1 | Haut-du-Them-Château-Lambert Le Thillot | Tunnel percé | E 100 |
| Ligne Rhin-Rhône (LGV) (21) | Chavanne LGV | 70147.1 | Chavanne Aibre | Tunnel percé | |
| Blainville-Damelevières (54) - Lure (70) | Fontaine-lès-Luxeuil | 70240.1 | Fontaine-lès-Luxeuil Luxeuil-les-Bains | Tunnel percé | |
| Gray (70) - Saint-Jean-de-Losne (21) | Mantoche | 70331.1 | Mantoche | Tunnel percé | |
| Tunnel en service |
| Tunnel non exploité ou abandonné |
| Tunnel remarquable |
Ligne ou section de ligne :
Le nombre entre parenthèses indique le numéro du département.
Le sens des sections n’est pas nécessairemement le même que celui des lignes.
Communes :
La première ligne indique la commune sur laquelle est située l'entrée du tunnel.
La seconde ligne indique la commune sur laquelle est située la sortie du tunnel.
Si une seule commune est indiquée, les entrée et sortie du tunnel sont situées sur cette même commune.
Observations :
Pour les lignes à voie étroite, l’écartement est précisé en centimètres (par ex : E 100 pour une voie métrique).